Кафедра существует с 1979 г. Первоначально была создана как кафедра зоологии и ботаники. Основатель – профессор Иван Антонович Костин, ученый-энтомолог из г. Алма-Ата.
В настоящем виде кафедра существует с 2009 года. Она образовалась при объединении двух самостоятельно сложившихся кафедр зоологии и физиологии человека и животных.
Кафедра экологии, биохимии и биотехнологии
Кафедра экологии официально открыта в 2003 году и является выпускающей по специальности «экология».
Физико-химической биологии и биотехнологии. Новая кафедра открыта в 2013 году.
Базовая кафедра фундаментальной и прикладной экологии
Кафедра фундаментальной и прикладной экологии – базовая кафедра, созданная на базе ФГУН «Институт водных и экологических проблем СО РАН» на основе договора о сотрудничестве между АлтГУ и базовым учреждением.
Базовая кафедра биологического образования в Алтайском крае
Базовая кафедра Алтайского государственного университета «Биологическое образование в Алтайском крае» создана на базе Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Гимназия №42» на основе договора о сотрудничестве между АлтГУ и базовым учреждением.
Прикладной ботаники и биотехнологии растений.
Лаборатория «Музей природы» располагает экспозиционным залом и вспомогательными фондами. Фонды музея состоят из учебных, научных и экспозиционных разделов, в которых представлено более 1200 экз. позвоночных животных, научная коллекция насекомых составляет около 3500 ед. хранения, а экспозиционная (видовая) часть – более 300 экспонатов.
Фундаментальной и прикладной зоологии
Основной целью лаборатории фундаментальной и прикладной зоологии является изучение биологического разнообразия плохо изученных групп наземных артропод Алтайской горной страны и сопредельных территорий, исследование слабо изученных территорий региона, выявление закономерностей распределения таксонов артропод, зоогеографические исследования.